プログラミング

INDELマーカーやCAPSマーカー作成を効率化するために
Perlのプログラムを書く。


今日の課題は、
日本晴/93-11間のINDEL/SNPのデータベースから、
ほしい領域の多型情報を抽出し、
その周辺配列のマルチFASTAファイルを作る。


一応それらしいものはできたが、
肝心のマルチFASTAから一気にプライマーを設計するサイトの
性能が悪くて、このままじゃ使い物にならない。


今日のプログラムはいずれ公開しようと思う。
誰か手直しいてくれるとありがたい。